El programa de Maestría promueve la movilidad de estudiantes con el fin de que tengan una preparación integral y de alto nivel, de tal forma que el intercambio de experiencias en las áreas de investigación complementa su formación. Las actividades a realizar en movilidad pueden ser cursar asignaturas, realizar estancias de investigación y hacer experimentación en otras instituciones de prestigio nacionales o del extranjero. Asimismo, el programa contempla que el alumno en conjunto con su director de tesis y en acuerdo con los demás miembros del Comité Tutorial definan las necesidades académicas y de investigación para fortalecer sus conocimientos y en consecuencia la conveniencia de la movilidad hacia otras instituciones. La constante colaboración de los profesores con investigadores de otras instituciones permite que los estudiantes puedan participar en los programas de movilidad estudiantil y solicitar apoyos económicos o becas tales como los ofrecidos por SANTADER-ANUIES, SANTADER-ECOES o los de la Coordinación de Cooperación Académica del IPN, los cuales permiten que los alumnos cursen asignaturas o realicen estancias de investigación por periodos de 3 a 5 meses en otras instancias durante su programa de estudio.